尽管温室甲鱼、黑鱼的养殖对水环境造成了很大影响，但执法部门却无法对养殖户采取有效措施，这是因为有关部门制定的农业废水排放标准滞后，当中更是缺乏工厂化温室甲鱼养殖、黑鱼养殖等废水排放标准，使得对温室甲鱼产业的废水治理没有依据和标准。水产养殖尤其是温室甲鱼、黑鱼养殖的污水治理已成为养殖污染治理的重点和难点。

为深入推进水环境综合治理，以实现养殖和环境协调发展，建议国家有关部门尽快出台工厂化温室甲鱼养殖等水产养殖废水排放标准，改变温室甲鱼等水产养殖废水排放标准的空白状态，让执法部门执法过程中有法可依，有据可循。