对于那些真正具有创新能力的企业，如果要靠政府的认定才来决定是否进行创新，或者要等待从政府那里获得资助后才来创新，那时恐怕为时已晚，或者也失去了创新的动力。创新的愿望、动力和能力完全应该是企业内生的，良好的激励机制的设计会起到积极的助推和促进作用。比如，最近笔者曾去参观一家制药企业，其刚上市的抗癌新药的研发时间长达十年。其成果初始阶段政府是无法做出判断的，最终证明其效果的是患者和市场。企业巨额的研发成本虽然可以自行消化，也可得到所得税方面的优惠，而流转税即增值税国家层面还没有相应的激励政策，按照现行增值税17%的税率，其进项抵扣微乎其微，显然将会对其造成很大的财务压力，17%的税率给这类企业会带来多大的负面影响，我们不好做简单的评判；但对于技术创新和发展，这样高的税率对其造成的负面影响是肯定的；而且对于鼓励技术进步和创新不仅不会起到促进的作用，甚至对其成果推广应用及进一步研发，都可能会产生阻碍作用。所以，对这类问题就必须由顶层设计来解决。

而按照目前对高新企业的认定管理来看，难免会发生如下问题：

1、虽然设置了一定的门槛，但由于经过一定的努力，特别是地方政府如果对高新企业数量的增加以政绩加以考量，那么在政府促使其认定成功的冲动助推下，这类企业认定通过率还是会比较高的。

2、由于完全是通过非专家人员（只是因为涉及税收方面的优惠，会有相关方面人士的参与考察）的审核，尽管有各种标准和指标，但仅凭这些描述性的信息是不能轻易地就肯定该企业在今后一段时间的创新和更好的发展前景；何况单凭专利，并不能表明其在这方面具备足够的创新能力；这一切其实是不能以政府认定的形式来确定，最终必须要由市场和实际产生的效益以及用户的评价来决定。

3、再者，一旦通过认定，该企业至少在未来三年将获得税收优惠和地方财政的补助。而即便会有审计或审核，从财务数据等方面是难以判断其真实性的。实际上为了获得相关的好处，造假是可能的，实际上也是存在的。

4、这是一种以计划经济的方式，来确定市场经济条件下的技术创新和进步。因为居然会有不少地方政府将每年产生多少家高新技术企业写入政府年度规划。而且这种方式还会导致财政资源的不当利用，也存在着滋生腐败的因素。

为此建议：

一、国家应专门研究如何来促进技术进步和创新的形式和机制，改变现今的认定办法，因为其不能促进真正有创新能力的企业更好地创新和发展，而且还造成税收和财政资源的不当利用，在一定程度上导致弄虚作假。

二、对技术创新企业的认定和激励应有顶层设计，应建立国家级的审核和认定专家库，并根据相关企业技术创新所产生的成果和实际业绩，由从专家库中随机组成的专家团队来加以评审，确定其是否符合相关标准。根据该客观评审结论，并综合考虑其成果和市场业绩，才可以享受相关的税收优惠政策。

三、对前述制药企业这类创新企业，就全国范围不会是个例，国家应当对此进行专项研究，从激励企业创新的角度来考虑如何设计相关的税收激励措施，是否对经严格评审并经事实证明确实具有很高的创新能力，并对社会产生重大影响的成果在增值税方面出台优惠政策，比如，对符合条件的企业采取以较低税率简易征收增值税的办法。

四、国家应当制定政策鼓励更多的以市场运作方式的民间资本对技术创新和进步具有潜能的企业进行扶持和投资，比如风险投资。在国家层面是否可考虑建立专项创新基金，通过创设严密的管理机制来激励那些能为国家带来具有战略意义的创新成果。

五、国家和各级地方政府应当引导企业和公众对创新的正确认识和理解，坚决杜绝创新似乎可以毕其功以一役的急功近利的风气和行为，以形成健康的创新文化。