一、企业的搬迁收入问题

企业取得的搬迁补偿收入是指企业由于搬迁取得的货币性和非货币性补偿收入，该项搬迁补偿收入是按当时政府出台的搬迁政策，经政府指定的中介机构评估搬迁“资产损失”及相关“搬迁费用”而确定的，并由政府部门与搬迁企业签定搬迁协议而进行的补偿。

搬迁资产损失是指企业搬迁让出的土地、原使用的房屋建筑物及因搬迁而不能再使用的设备的价值，补偿的目的是对这些因搬迁而失去的企业资产损失（土地按基准价格、房屋以面积和政策规定价格、设备按评估原值）进行一对一的补偿，使企业在异地搬迁后能进行重置，以保持原有的生产能力。

因此，企业在得到补偿后可以在政府协调下异地取得土地、建设房屋建筑物、购置受损的设备并安装搬迁过来的设备，重新恢复生产。但这种收入是一种简单再生产的必要补偿，而不是资产的增值或经营的利润，对这部分补偿收入的计税应该采用谨慎的政策。

二、企业的搬迁支出问题

《企业政策性搬迁所得税管理办法》（以下简称“办法”）对搬迁支出定义为：企业的搬迁支出，包括搬迁费用支出以及由于搬迁所发生的企业资产处置支出。

对于搬迁费用支出界定，除可以以“搬迁资产损失”的一定百分比简化计算搬迁费用外，应该是与当时搬迁时所定政策基本一致。

主要的问题是确定资产处置支出，“办法”中的定义为：“资产处置支出，是指企业由于搬迁而处置各类资产所发生的支出，包括变卖及处置各类资产的净值、处置过程中所发生的税费等支出。”其中土地的置换成本是按新取得土地的费用作为计税成本，但其他资产的成本则“应按《企业所得税法》及其实施条例等有关规定，计算确定资产的计税成本及折旧或摊销年限。”

这里的差别在于：其他资产的搬迁成本是按原资产账面价值经折旧后的净值确定，这就造成了搬迁当时各项资产的实际价值与账面价值不是一致的，这部分资产随着市场货帀价值与购建成本的变化，其账面价值早已背离了市场价值（实质是增值了），在资产转让或股权变更前，税法并没有规定对这部分仍在使用中资产的增值征税。

企业搬迁是企业受政府政策的影响而被动发生的，因此这些资产如果不搬迁、企业仍在使用中是不会发生征税事项的，因此搬迁中应视为正常使用中的资产。例如企业某幢房屋账面价值1000万元，折旧后净值600万元，但在搬迁时建设同样面积和标准的房屋造价需要2000万元（原框架结构每平方造价约600元，现在约需1200元以上），按成新70%其净值在1400万元，按“办法”计算的计税成本如果按账面净值（600万元）明显是太低了，也就是说将多征收了800万元收入的税金。

三、应税所得问题

按上例，如果补偿的搬迁收入是2000万元，按账面净值600万元为计税成本，应税所得就是1400万元，而按搬迁资产的实际价值1400万元为计税成本，应税所得就是600万元。搬迁企业认为只要企业在持续经营中，合理的应税所得应该是：按搬迁收入扣除损失的搬迁资产实际价值后的净收入。

四、政府行为的时间后滞问题

当时政府与企业在签订搬迁协议时，并未考虑这部分净收入应该计缴的所得税，也未明确宣示税收的相关政策，让搬迁企业有一种“秋后算账”的感觉。因为如果需要征收所得税，当时在补偿收入的计算时就应该包含这部分所得税费用，现在企业用搬迁补偿收入完成或正在完成搬迁重建时，相关资金已经全部投入或已经列入重建预算中，现在要对“搬迁所得”开征所得税，而且是一笔巨大的纳税资金，企业难以筹措这项开支，再加正逢企业面临全球经济危机，必然会给企业带来种种不利影响。

五、企业应向主管税务机关报送相关材料问题

“办法”还规定了企业应向主管税务机关报送的政策性搬迁依据、搬迁规划等相关材料，共计五项。这些资料其实许多都是在搬迁当时不具备的（当时政府在签协议时并未要求提供），或者是由负责企业搬迁事务的政府机关发布的（如政府搬迁文件或公告），现在要时过几年的、已搬迁离开原所在地（市）的企业提供，有一种坐在办公室的人自说自话的感觉。笔者亲自见到有搬迁企业到处盲目找人、找部门索要“本就不由企业保管的相关资料”情况。

六、“办法”对个人搬迁的影响与思考

由于“办法”的出台，对同样原因、相似政策的居民住宅、农村住宅拆迁补偿是否也会发生征收所得税，这也是搬迁企业和个人提出的疑问：为什么同样的政府行为有不同的税收政策？如果补偿给个人的异地安置补偿五年不购房，或实际购房款少于补偿款，要不要缴纳个人所得税？一项法规的出台，是否应该充分考虑它的社会影响和历史因素？